PHD OPPORTUNITY · BOOKUNI
博士研究生岗位 F/M [Numetab项目] 在存在竞争风险的情况下,基于生存建模框架进行高维数据分析研究。
法国国家信息与自动化研究所Inria
巴黎 · 法国
01项目概览
该博士项目旨在利用高维重复数据,开发一种用于存在竞争风险下的生存分析中变量选择的新型统计方法。研究重点在于寻找精准健康领域的组学标志物,并致力于开发作为临床场景决策支持工具的方法论与软件。申请者应拥有生物统计学硕士学位,且具备使用R语言及Python等脚本语言的能力。
02研究内容
任务:
博士论文的研究目标在于开发一种新的统计方法,用于在存在竞争风险的情况下进行生存分析中的变量选择,该方法需对数千个变量进行随时间重复的测量。 该博士项目由 Numetab 跨学科项目“肥胖与代谢研究中的数值过渡”资助(项目负责人为 Pattou 教授及 [会员信息])。
申请旨在寻找新的组学标志物(转录组学、代谢组学、蛋白质组学),以用于预测性研究,从而调整患者的治疗方案(精准健康)。该统计方法的独特之处在于同时解决三个科学挑战:i) 高维分析(变量数量多于个体数量),ii) 在生存模型背景下对竞争风险的分析,以及 iii) 纵向数据分析(对同一个体进行重复测量)。
在生物统计学方法及提供临床决策支持工具的相关软件方面,预期均将取得成果。
主要工作内容:
主要目标是开发一种统计方法,用于在存在竞争风险的情况下进行生存预测,并选择相关变量。
次要目标为:
旨在改进基于重复组学数据的分析中生物标志物的寻找方法
开发一种决策支持软件工具,该工具具有通用性,可在存在竞争风险的情况下使用生存模型进行高维数据分析的任意应用场景中应用。
欲理解此博士项目所需概念的博士候选人,可阅读以下参考文献:
- 与统计学相关
[1] Fine 与 Gray (1999) 提出一种用于竞争风险下部分分布概率的比例风险模型。《美国统计学会杂志》,94(446):496–509。
[2] Chi 和 Ibrahim (2006) 关于多变量纵向数据及多变量生存数据的联合模型。《生物测量学》,62(2):432–445。
[3] Binder、Allignol、Schumacher和Beyersmann(2009)提出一种用于具有竞争风险的高维时间至事件数据的提升算法。《生物信息学》,25(7):890–896。
- 与另一份申请相关,该申请是获得博士学位的研究主题动机(蛋白质组学数据分析)
[4] Heyse、Vandewalle、[会员信息]、Amouyel、Bauters和Pinet(2023)基于蛋白质表达识别患者亚型,以预测心肌梗死后的心力衰竭。Iscience, 26(3)。
03申请条件
技能:
申请人必须拥有生物统计学硕士学位。
所需的技术技能与水平:
精通 R 语言及至少一种脚本语言(如 Python)
对统计学习有深入的了解,以处理高维数据
生物学基础知识(分子与细胞生物学、基因组学与遗传学)
其他重要的优势包括:创造力、独立性、团队协作能力以及沟通技巧
04资助与待遇
福利包:
补贴餐食
部分公共交通费用报销
休假规定:每年7周年假 + 因RTT(法定工作时间减少)额外享有10天假期 + 可能享受特殊假期(如照顾生病的子女、搬家等)。
远程工作及灵活工作时间安排的可能性
提供专业设备(视频会议、计算机设备借用等)
社会、文化和体育活动及项目
职业培训机会
社会保障覆盖范围
薪酬:
每月总工资为2,300欧元
申请该职位
05申请材料与流程
暂无中文译文,暂显示原文
Instruction to apply:
Please send us your CV and cover letter.
Defence Security : This position is likely to be situated in a restricted area (ZRR), as defined in Decree No. 2011-1425 relating to the protection of national scientific and technical potential (PPST).Authorisation to enter an area is granted by the director of the unit, following a favourable Ministerial decision, as defined in the decree of 3 July 2012 relating to the PPST. An unfavourable Ministerial decision in respect of a position situated in a ZRR would result in the cancellation of the appointment.
Recruitment Policy : As part of its diversity policy, all Inria positions are accessible to people with disabilities.